Предприятие имеет в своей структуре 13 филиалов, в том числе пять линейно-производственных управлений магистральных газопроводов — Тарумовское, Кизилюртовское, Махачкалинское, Избербашское, Дербентское. ООО «Газпром трансгаз Махачкала» — 100-процентное дочернее общество ОАО «Газпром», является крупнейшим предприятием топливно-энергетического комплекса Дагестана.
