Основные функции Агентства - оказание государственных услуг и осуществление правоприменительных функций в сфере управления особыми экономическими зонами, а также контроль за выполнением соглашений о ведении промышленно-производственной или технико-внедренческой деятельности. РосОЭЗ осуществляет мониторинг реализации соглашений о создании ОЭЗ, регистрацию юридических лиц и индивидуальных предпринимателей в качестве резидентов ОЭЗ, а также контроль за исполнением резидентами соглашения о ведении промышленно-производственной или технико-внедренческой деятельности.
РосОЭЗ находится в ведении Министерства экономического развития и торговли Российской Федерации.
